堆肥發酵菌種是一種復合菌種能快速分解有機質，具有添加量少、強力降解蛋白質、發酵時間短、成本低、發酵溫度不受限等優點，堆肥發酵菌種能有效殺死發酵物中的有害菌、蟲、蟲卵、草籽并降解抗生素殘留等。繁殖快速、生命力強、安全無毒等特點。
堆肥發酵菌種含有高濃度的非致病性有益微生物，并添加了能夠分解各種大分子物質的多種酶。該產品中的微生物能夠在堆肥過程中產生消化酶來分解發酵堆肥中的有機質。在堆肥過程中添加本濃縮產品以補充原始菌種，并加強對有機質的分解以便利用城市垃圾、廢水污泥、固體廢物生產腐殖質堆肥。
污泥堆肥作用機理：
好氧條件下，堆肥物料中的可溶性有機物透過微生物的細胞壁和細胞膜被微生物吸收；固體和膠體有機物質先附著在微生物體外，由微生物分泌胞外酶將其分解為可溶性物質，再滲入細胞。微生物通過自身代謝活動，使一部分有機物被氧化成簡單的無機物，并釋放能量，使另一部分有機物用于合成微生物自身細胞物質和提供微生物各種生理活動所需的能量，使機體能進行正常的生長與繁殖，保持生命的連續性。
堆肥中的微生物在分解過程中產生大量的熱來給堆肥加熱。這種高溫對快速分解是必需的，而且有利于破壞雜草的草種、昆蟲的幼蟲、有害細菌等，并能抑制某些疾病的滋生，避免這些疾病產生有害微生物阻礙植物的正常生長。
發酵微生物菌群的添加能夠提高分解速度與效率，因為這些菌群是經過篩選、馴化、培養并改良的高濃縮細菌與真菌混合物。這些菌種被選來更好的生存與繁殖、同時產生酶，分解有機廢物，從而在堆肥生成過程中加速有機質的分解。
分解木質纖維素菌體的標準概念是先打開纖維結構使糖可用于不同微生物的新陳代謝。微生物利用纖維素酶、木聚糖酶、淀粉酶、蛋白酶、分解木質素的酶等從纖維素、半纖維素、蛋白質、淀粉和其他碳水化合物中向堆肥釋放糖分。目標菌在堆肥中的生長加強了，就能有效抑制雜菌生長，從而防止產生臭味和致病菌等有害物質。