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離子色譜儀分離測定常見的陰離子是它的專長，一針樣品打進去，約在20分鐘以內就可得到7個常見離子的測定結果，這是其他分析手段所無法達到的。
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 離子色譜主要用于環境樣品的分析，包括地面水、飲用水、雨水、生活污水和工業廢水、酸沉降物和大氣顆粒物等樣品中的陰、陽離子，與微電子工業有關的水和試劑中痕量雜質的分析。
      另外在食品、衛生、石油化工、水及地質等領域也有廣泛的應用。
經常檢測的常見離子
陰離子：F-, Cl-, Br-, NO2-, PO43-, NO3-, SO42-，甲酸，乙酸，草酸等。
陽離子：Li+, Na+, NH4+, K+, Ca2+, Mg2+, Cu2+, Zn2+, Fe2+, Fe3+等。