為了保護三峽庫區水環境安全，重慶市制定出臺了相關區域和流域水污染防治辦法，規定禁止三峽庫區l75米淹沒區內從事網箱養殖，同時對該區域的畜禽養殖也予以限制。

根據今年10月1日正式施行的《重慶市長江三峽水庫庫區及流域水污染防治條例》，各區縣（自治縣）在經濟社會發展規劃中，應當制定畜牧業發展規劃，合理布局畜禽養殖，劃定畜禽禁養區、限養區并實施分類管理。條例規定，主城區各街道轄區和其他區縣（自治縣）的城市建成區以及繞城高速公路環線以內的其他區域；飲用水水源一級、二級保護區；自然保護區的核心區和緩沖區、風景名勝區、森林公園重要景點和核心景區等區域，應當劃定為畜禽禁養區。禁養區內禁止新建畜禽養殖場，已有畜禽養殖場應當關閉或者搬遷。

根據條例，城市規劃區及規劃區以外廣西小龍蝦養殖技術的居民集中區、醫療區、文教科研區、工業區；飲用水水源準保護區；自然保護區的實驗區、風景名勝區外圍保護地帶、森林公園重要景點和核心景區以外的其他區域等，劃定為畜禽限養區。限養區實行畜禽養殖存欄總量控制。畜禽養殖場、屠宰場、養殖小區所產生的畜禽糞便和其他廢棄物應當無害化利用。確需排小龍蝦養殖廠放的，經處理小龍蝦養殖技術論壇后應當達到國家和本市規定的排放標準。

條例明確規定，禁止采用向庫區流域水體投放化肥、糞便、動物尸體（肢體、內臟）、動物源性飼料等污染水體的方式從事水生養殖，特別是禁止三峽庫區l75米淹沒區內從事網箱養殖。對于違反規定的，由農業主管部門責令停止違法行為，處十萬元以下罰款，并責令拆除網箱養殖設施。