目錄本草綱目第一卷序例上歷代諸家本草引據古今醫家書目引據古今經史百家書目采集諸家本草藥品總數神農本經名例陶隱居名醫別錄合藥分劑法則采藥分六氣歲物七方十劑氣味陰陽五味宜忌五味偏勝標本陰陽升降浮沉四時用藥例五運六淫用藥式六腑六臟用藥氣味補瀉五臟五味補瀉臟腑虛實標本用藥式引經報使本草綱目第二卷序例下藥名同異相須相使相畏相惡諸藥相反諸藥服藥食忌妊娠禁忌飲食禁忌李東垣隨證用藥凡例陳藏器諸虛用藥凡例張子和汗吐下三法病有八要六失六不治藥對歲物藥品神農本草經目錄宋本草舊目錄本草綱目第三卷百病主治藥上　諸風　痙風　項強　癲癇　卒厥　傷寒熱病　瘟疫　暑　濕　火熱　諸氣　痰飲　脾胃　吞酸嘈雜　噎膈　反胃　嘔吐　噦畹　呃逆　霍亂　泄瀉　痢　 本草綱目第四卷百病主治藥下本草綱目第五卷水部本草綱目第六卷火部本草綱目第七卷土部