飲水機清洗方法有很多種，但是據西安小手帕專業飲水機清洗公司的工作人員講：40%左右的家庭從未清洗過飲水機，而清洗過的家庭中有87%的只是自己簡單擦洗一下，并且清洗的方法也是不科學不專業的。目前市場上使用最多的是以下幾種清洗方法： 第一種浸泡法： 它是利用消毒液浸泡飲水機的各個管路達到清潔目的。使用二氧化氯消毒時，用50～100mg/L濃度的溶液浸泡5分鐘即可，雖然成本低，可化學殘留物不易清洗掉；使用雙氧水消毒時，浸泡時間同為5分鐘，濃度為1.5%，化學殘留易清洗但成本很高。另外，甲醛、二醛等醛類消毒劑盡管殺菌能力很強，無奈刺激性氣味大，而且沒法對飲水機的內膽、管壁、分水管道等部位進行循環沖洗，難以將污物帶出，存在“二次污染”。這是目前各種品牌純凈水廠家對客戶承諾提供的所謂免費清洗消毒服務。 第二種熏蒸法： 該方法是利用臭氧的殺菌作用來達到清洗飲水機的作用。將臭氧從飲水機上部的入水口注入，大約經過20分鐘的熏蒸可以殺滅大部分的有害細菌，此方法消毒效果很好，且成本較低，但沒有清洗水垢等雜質的作用。 第三種加壓過濾法： 采用加壓過濾方法的專業飲水機清洗機械。在清洗時，將清洗機的一端接到飲水機的入水口，另一端接入飲水機下部的排水口，形成一個封閉循環，同時采用專用消毒清洗劑。該方法利用清洗機械自身的循環壓力，可以充分達到清洗的目的，然后通過機械壓力可以將水垢和雜質完全排出。這種方法一般被專業的飲水機清洗公司所采用。